Mit dem usb Kabel sollte es klappen 
Ich wünsche dir viel Glück/Erfolg...
Ich habe im E90 mit Nachgerüsteter USB Schnittstelle (MULF2) 2 Jahre Lang ohne Probleme einen iPod Classic dran gehabt. Der ist recht konstant alle 3-4 Monate mal hängen geblieben und gut.
Hierzu hat man das Original BMW Apple Y-Kabel verwenden müssen.
Jetzt im F11 habe ich ab Werk die Combox drinnen (so wie du auch). Dort funktioniert der iPod auch auf Anhieb mit nem normalen USB-Kabel. Dann funktioniert auch die Coveranzeige (was bei deinem glaube ich aber noch kein Thema sein sollte).
Jedoch steigt der iPod alle 5-10x Motorstarten aus. Sprich bei mir alle 2-3 Tage und zwar so, dass du in Softresetten musst (HOLD => Menü + OK 10sek) und danach wieder anstecken.
Austausch der Kabel hat nix gebracht. Ich habe das Original Apple Kabel, das Original BMW Kabel, Hama Billig Kabel, etc ausprobiert bei allen das gleiche...
Verwende ich nun das Original BMW Apple Y-Kabel funktioniert alles wie es soll und auch stabil. Jedoch ohne Coveranzeige. Solltest du Webradio via BMW Apps hören geht das auch nicht solange das Klinkenkabel vom Y-Stecker eingesteckt ist...
Das Ende vom Lied bei mir:
Ich verwende das Tool itunesfusion. Dieses liest sämtliche Infos aus iTunes aus vor allem auch deine Playlist und pakt diese auf einen USB-Stick. Beim Kopieren konvertiert er auch gleich noch alles in MP3s. USB Stick ans Auto und ruhe. Es ist deutlich stabiler und schneller als mit dem iPod und das Tool kostet keine 10€. Die USB Sticks haben 35€ gekostet und sind im Vergleich zum iPod absolut Shock Resistent.
Jetzt habe ich im Auto zwei 128GB USB Sticks (1x Musik, 1x Hörbücher) und ruhe im Karton.